Molécule organique

“ Souvenez-vous que, pour un chimiste, la matière organique n'est autre chose qu'une combinaison du carbone, un composé chimique comme un autre, un acide, une base, un sel, un corps indifférent ou singulier. Oui, peut-on dire qu'une matière organique ainsi définie, quelque complexe que soit sa molécule , ou quelque nombreuses que soient les espèces que l'on suppose mêlées, puisse être réputée vivante? Ou bien l'idée de vie suppose-t-elle l'organisation avec structure ”

“ On considère tous les corps qui remplissent l'espace comme étant composés de petites particules désignées sous le nom de molécules. Dans les corps chimiquement simples, comme l'hydrogène, l'oxygène, le soufre, le fer, etc., ces molécules sont composées d'atomes semblables entre eux ; dans les corps composés, comme l'eau, l'acide carbonique, etc., chaque molécule est formée de plusieurs atomes de nature différente. ”

“ Leur molécule est très complexe, d'un poids très élevé : elle est le chef-d'œuvre d'équilibre chimique de la vie; aussi est-elle très instable, s'hydratant, se déshydratant, se dédoublant sous de légères influences, avec une facilité très grande. ”

“ Nous savons d’autre part que les corps composés sont des agrégats de molécules identiques, formées elles-mêmes d’assemblages d’atomes élémentaires distribués d’après des lois qui en règlent la nature, la proportion et l’arrangement. L’individu, pour chaque corps composé, c’est sa molécule chimique, et celle-ci est un groupe d’atomes, non pas un groupe pêle-mêle ”

“ Telle molécule, qui est maintenant incorporée dans notre organisme, va s’en échapper par l’expiration, la transpiration, etc., appartenir à l’atmosphère pendant un temps plus ou moins long, puis être incorporée dans un autre organisme, plante, animal ou homme. Les molécules qui constituent actuellement votre corps n’étaient pas toutes hier intégrées à votre personne, et aucune n’y était il y a quelques mois. ”

“ Et cependant, c'est du fond de ces limbes, c'est de ces limites lointaines que s'élance la vie. Silencieuse tout d'abord et à peine perceptible, elle monte de molécule en molécule, organisant dès le début, suivant des formes progressives, les corps inertes qu'elle traverse. ”

“ Toutes les molécules d’un corps chimiquement défini sont identiques ; c’est la structure atomique de la molécule qui définit le corps ; toutes les propriétés du corps sont inhérentes à la structure atomique de sa molécule ; n’importe quelle molécule du corps peut remplacer, sans que rien change, toute autre molécule du même corps dans n’importe quelle réaction. ”

“ La chimie organique touche à la biologie : de là sa grandeur, et aussi ses difficultés. La chimie biologique ne pouvait se développer qu’après l’étude systématique de la chimie du carbone. Durant un siècle, on a pensé que la chimie biologique n’utilisait dans ses multiples transformations que quatre corps simples : le carbone, l’hydrogène, l’azote et l’oxygène. ”

“ Nous ne connaissons que des molécules. Les molécules sont les élémens physiques des corps : ce sont des groupemens d’atomes réunis chimiquement à d’autres de même nature, et on a alors les molécules des corps simples, et par exemple la molécule d’hydrogène formée de deux atomes, celle du soufre qui réunit six atomes, celle de l’arsenic qui en groupe quatre. Si les atomes sont réunis à des atomes différens on a les corps composés. ”

“ En elle-même et par les notions qui la préparent, la construction de la molécule est une opération essentiellement idéale. Pas plus que l’atome, pas plus que la molécule elle-même, l’arrangement des particules élémentaires n’est saisi par l’observation. Conséquence de prémisses purement idéales, la conception de cette structure a le même caractère que les notions d’où elle dérive. ”

“ Jusqu'à lui, c'est-à-dire pendant la première moitié de ce siècle, la chimie organique avait suivi une marche essentiellement analytique. Elle s'efforçait d'isoler les principes immédiats contenus dans les êtres vivants et elle les soumettait à une série de décompositions et de transformations, destinées à aboutir en définitive aux éléments et aux composés binaires, tels que l'eau et l'acide carbonique. ”

“ Comment faut-il entendre leur nombre pour s’assurer que l’abaissement du peint de congélation est proportionnel à ce nombre ? Et comment connaître ce nombre ?
On a commencé par prendre le mot de molécule dans l’acception ordinaire que lui donnent les chimistes. Ceux-ci, en effet, distinguent les dernières particules chimiques des corps ou atomes et les dernières particules physiques ou molécules. L’atome d’un corps est la plus petite portion de ce corps qui puisse exister dans les combinaisons ; les énergies chimiques sont inhérentes à l’atome ; les forces chimiques s’exercent entre atomes ”

“ Les atomes qui composent ce corps peuvent, surtout si nous ne nous contentons pas de la simple isomérie, si nous consentons à scinder la molécule, constituer des corps qui seront acides, bases, alcools, aldéhydes, acétones, etc. ”

“ Si nous supposons la molécule vivante composée d'un noyau autour duquel rayonnent les chaînes latérales ou groupes fonctionnels chargés des échanges avec le milieu, nous comprendrons facilement les troubles apportés dans la chimie de la molécule par la défectuosité de la composition du milieu ou par les atteintes aux affinités de ces groupes, à la suite des diverses intoxications.'L'un ne va pas sans l'autre. ”

“ Les composés non vivants procèdent par combinaisons binaires des molécules de corps simples, comme l'air, qui se compose d'oxygène et d'azote; ce système binaire des éléments se retrouve encore dans la formation des corps surcomposés. Les corps vivants au contraire, exigent dans chaque particule organique, la combinaison de trois éléments simples pour le moins, à savoir : de l'oxigène, de l'hydrogène, et du carbone dans les plantes, auquel s'ajoute l'azote dans les animaux. ”

“ Les deux termes extrêmes de la chimie organique sont : d’une part le végétal ou l’animal vivant, de l’autre ces quatre corps simples, — carbone, oxygène, hydrogène, azote, — qui forment le tissu de toute substance organisée, et qui subsistent encore lorsque le principe mystérieux de la vie a disparu. L’analyse élémentaire est l’opération chimique qui ramène les matières organisées à ces derniers élémens ; elle opère ce que fait la mort elle-même, une véritable destruction, un retour de l’organisation à l’inertie primitive. ”

“ C’est, tout à l’opposé, la molécule individuelle qui, par voie d’entente, et d’extension ou de développement, se joint aux molécules les plus proches, et forme noyau avec celles-ci, puis, passant par des organismes de plus en plus vastes, le cercle de l’Entente s’élargissant toujours, réunit, en une vie de plus en plus intense, féconde et heureuse, la totalité des molécules individuelles. ”

“ Une molécule composée d'un petit nombre d'atomes, facile à dissocier, peut céder une quantité de vie supérieure à celle qui serait abandonnée par une molécule complexe qui contiendrait une accumulation plus considérable de vie, mais qui serait plus stable et garderait en elle sa vitalité. ”

“ Une molécule protéique est très volumineuse, car elle se compose d'un très grand nombre d'atomes de ses éléments constituants ; ces atomes peuvent être reliés les uns aux autres de différentes manières; la molécule, tant qu'elle fait
partie de protoplasma vivant, peut prendre de nombreuses formes, et offrir de nombreuses occasions à l'accomplissement d'une grande variété de phénomènes chimiques ”

“ Si donc tous les corps sont des résultantes de molécules groupées, il faut que toutes les catégories de la nature soient impliquées dans chaque molécule, que toutes les espèces d’activité physiques, chimiques, vitales, morales s’y trouvent contenues à un certain degré ; le monde est tout entier dans chaque molécule, et toutes sont de même nature, puisqu’elles se suppléent perpétuellement comme composantes dans leur circulation sans fin d’un corps à l’autre. ”

“ La molécule i se trouve celle qui forme le centre de la terre, celle sur laquelle se dirigera le fil à plomb, parce qu'elle unit sa force d'attraction conjointement avec la masse générale des autres molécules ”

“ Chaque laboratoire a donc ses agents spéciaux, mais les phénomènes chimiques sont au fond les mêmes : la transformation de l'amidon en sucre, le dédoublement de la graisse en acide gras et en glycérine, se produisent dans les deux cas par un mécanisme chimique identique.
Pour les phénomènes de création organique, il doit en être de même. Le chimisme de laboratoire peut opérer les synthèses comme les corps vivants, et déjà il en a réalisé un grand nombre. Les chimistes ont fait des essences, des huiles, des graisses, des acides, que les organismes vivants fabriquent eux-mêmes. ”

“ Au contraire, dans des molécules vivantes en voie d'assimilation, à une molécule donnée succèdent des molécules identiques qui la continuent, et dans lesquelles se continue l'activité chimique; les réactions vitales sont continues, les réactions de la chimie brute sont extemporanées. Pendant une série de réactions vitales continues, un mouvement lumineux peut se terminer, une vibration calorifique s'accomplir; il y a, dans la conscience du protoplasma vivant, une accumulation de connaissances successives ”

“ Seulement la substance vivante se distingue de toutes les. substances minérales par son extrême complexité chimique.
8. Variabilité spontanée. — La molécule protoplasmique n'est pas seulement une agrégation complexe d'un nombre plus ou moins considérable de corps simples, comme le carbone, l'hydrogène, des métaux, etc., que nous révèle l'analyse élémentaire de l'être. Ce qui la distingue plus encore (mais non absolument) des molécules inertes, c'est sa grande variabilité ”

“ En outre, chaque molécule étant une masse et non une pure manifestation d’activité, la matière est supposée par cela même substantiellement divisée ; il y a autant de substances minimes que de molécules. ”

“ Toutefois, si la nature organique a, comme le règne minéral, ses acides, ses oxydes, si elle présente des corps répondant, sinon par leur composition, du moins par leur rôle, aux corps simples de la chimie inorganique, elle l’emporte de beaucoup sur lui pour la variété des types ou catégories de substances. ”

“ On peut, d'après ce qui précède, définir la molécule, la particule excessivement petite d'un corps qui ne subit plus d'altération dans les réactions chimiques. Tous les corps composés sont dans le même cas que le compose d'or et dé plomb; le nombre des molécules constituantes sera égal au nombre des éléments que contiendra le corps composé. ”

“ Que l'on admette donc, avec la plupart des observateurs les plus célèbres, que les tissus des végétaux et des animaux sont formés de molécules organiques bien distinctes, ou que l'on pense avec d'autres qu'il soit difficile ou même impossible d'en constater les formes, on ne peut révoquer leur existence en doute, et nier que tout mouvement organique ne soit le résultat d'une action moléculaire. ”

“ Si pour les matières azotées ou albuminoïdes les procédés de synthèse sont beaucoup plus obscurs, cela tient à ce que la chimie organique est encore trop peu avancée ; mais il est bien certain néanmoins que ces substances se forment par les procédés chimiques dans les organismes des êtres vivants. À la vérité, on peut dire que les agents des synthèses organiques, les germes et les cellules, constituent des agents tout à fait exceptionnels.
On pourrait dire de même pour les phénomènes de désorganisation que les ferments sont aussi des agents particuliers aux êtres vivants. ”

“ Si donc l'on envisage un corps minéral quelconque, chacune de ses molécules considérée isolément, en supposant la division poussée à l'extrême, possède toutes les propriétés du corps entier; cependant une molécule n'en est pas une autre, elle est soi ”

“ Tout corps brut ou inorganique n'a l'individualité que dans sa molécule intégrante : les masses, soit solides, soit fluides, soit gazeuses, qu'une réunion de molécules intégrantes peut former, n'ont point de bornes ”

“ Ces molécules sont-elles de même nature ou ne diffèrentelles les unes des.autres que par les forces qui règlent leurs positions relatives, ou bien diffèrent-elles aussi par leur constitution intime et régissent-elles par là les propriétés spécifiques des diverses cellules de l'organism e? Les molécules se multiplient-elles dans les cellules de manière à constituer dans chacune un tout complet comme dans l'œuf? Dans ce cas, les diverses molécules du réseau sont-elles identiques entre elles et comme formées par la multiplication d'une molécule unique, ou sont-elles diverses comme dans-l'oeuf ? ”

“ Ces molécules, formées de milliers d'atomes disposés suivant une architecture infiniment variée mais toujours très complexe, sont d'une sensibilité extrême aux moindres influences et certaines d'entre elles, d'un poids moléculaire particulièrement élevé, telles que les virus-protéines, manifestent des propriétés qui permettent de les regarder comme constituant des intermédiaires entre les êtres vivants les plus simples et les composés inertes les plus complexes de la chimie organique. ”

“ La chimie organique fait l'étude de toutes ces substances, non-seulement au point de vue de leurs propriétés particulières, mais aussi à celui de leurs transformations et des actions réciproques si variées qu'elles peuvent exercer l'une sur l'autre. ”

“ L’évolution d’un être nouveau, ainsi que sa nutrition, sont de véritables créations organiques qui s’accomplissent sous nos yeux. Toutefois ces phénomènes de création organique ne peuvent s’appliquer qu’à l’arrangement moléculaire matériel spécial qui caractérise la matière organisée, car les corps chimiques élémentaires qui composent la matière organisée sont absolument les mêmes que ceux qui forment la matière inorganique. ”